El abandono escolar temprano en educación superior es un problema frecuente, generalmente provocado por mala orientación vocacional y aspectos motivacionales. Para determinar los factores que predisponen al abandono, se efectuó un estudio de casos (N=391) y controles (N=782) en primo cursantes de las cohortes 2010, 2012 y 2013 inscritos en primer año de la carrera de Medicina de la Facultad de Ciencias Médicas de la Universidad de San Carlos de Guatemala (USAC), que no continuaron sus estudios en la Facultad, al año siguiente de su primera asignación. Se consideraron factores demográficos, académicos, familiares, laborales, motivacionales y de salud y se analizaron los que influyen significativamente en el abandono. Los resultados obtenidos indican que el nivel educativo del padre, la religión y el hecho de efectuar un trabajo remunerado simultáneo con los estudios, además del resultado final en los cursos de Química, Física, Biología y Psicología, son factores que predisponen al abandono en la educación superior. Como hallazgo incidental que amerita estudios posteriores, se detecta que el hecho de no interpretar algún instrumento musical se asocia con abandono. Se sugieren acciones para disminuir la repitencia en estos cursos y con ello evitar el abandono temprano en la Facultad de Ciencias Médicas de la USAC y dar un seguimiento estrecho a estudiantes que se inscriban en los próximos años y que presenten los factores de riesgo mencionados para evitar el abandono.